Examinando por Autor "Villanova, Gabriela Vanina"
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Ítem Acceso Abierto Assessing genetic diversity for a pre-breeding program in Piaractus mesopotamicus by SNPs and SSRs(MDPI, 2019-08-31) Mastrochirico-Filho, Vito Antonio; Del Pazo, Felipe; Hata, Milene Elissa; Villanova, Gabriela Vanina; Foresti, Fausto; Vera, Manuel; Martínez, Paulino; Porto-Foresti, Fábio; Hashimoto, Diogo TeruoÍtem Acceso Abierto Cost-effective method to perform SARS-CoV-2 variant surveillance: detection of Alpha, Gamma, Lambda, Delta, Epsilon, and Zeta in Argentina(Frontiers Media, 2021-12-10) Proyecto Argentino Interinstitucional de genómica de SARS-CoV-2; Posner, Victoria María; Villanova, Gabriela Vanina; Acosta, Julián; Cavatorta, Ana LauraÍtem Acceso Abierto Desarrollo de herramientas genómicas para la gestión del cultivo de peces nativos(2020) Del Pazo, Felipe; Sciara, Andrés; Villanova, Gabriela VaninaEn Sudamérica la mayor parte de la producción por acuicultura se ha basado en especies introducidas, aunque en los últimos años se ha avanzado en la generación de tecnología de cultivo para especies autóctonas. Entre estas se encuentra el pacú Piaractus mesopotamicus, una de las más importantes cultivadas en Sudamérica. El pacú es una especie migratoria, omnívora distribuida en la Cuenca del Plata cuyas poblaciones se han reducido en las últimas décadas por la sobrepesca y la modificación de su ambiente. En Brasil y Argentina su cultivo se realiza en zonas de clima subtropical templado (15-30°C). La acuicultura de pacú se basa en líneas no mejoradas, limitándose a la utilización de híbridos entre especies, y reproductores provenientes de la naturaleza, sin registro. El conocimiento de la diversidad genética de poblaciones silvestres y de cultivo es esencial para el gerenciamiento de las poblaciones y la fundación y mantenimiento de los planteles de reproductores Por otro lado, conocer los límites de tolerancia de temperatura resulta fundamental para el desarrollo de acuicultura y ampliar la extensión del cultivo hacia zonas menos cálidas. En esta tesis evaluamos la diversidad genética y estructura de poblaciones silvestres y de cultivo en Argentina y Brasil, como así también los parámetros de tolerancia a frío para el entendimiento de los factores genéticos y fisiológicos involucrados en esta respuesta. En cuanto al estudio de diversidad y estructura genética, se observaron niveles bajos y similares de diversidad genética entre los centros de cultivo y los sitios silvestres. La población silvestre evidenció una diferenciación genética baja, aunque significativa, presentando los sitios de muestreo W3 y W7 los valores más altos de diferenciación. Los resultados de los análisis de AMOVA y STRUCTURE sugieren que la población silvestre de pacú estaría representada por una única unidad panmíctica. En cuanto a la población de cultivo, el Fst global sugiere una estructura genética moderada y significativa. Se observaron valores de Ne bajos, presencia de cuellos de botella recientes, y en promedio, el 48% de los individuos en los centros de cultivo estaban emparentados. También se descartó la presencia de híbridos de pacú. Basado en los resultados obtenidos, recomendamos considerar seriamente las prácticas de manejo de reproductores para reducir los niveles de endogamia, e implementar prácticas que impliquen el uso de Ne mayores, apareamiento de a par, y registros y etiquetado de los individuos. Por otro lado, se evaluaron parámetros de respuesta y tolerancia a frío en una población de pacú mediante un sistema RAS con control térmico. Se estimó las temperaturas de cese de consumo de alimento (TCCA), temperatura de pérdida de equilibrio (LET) y la tolerancia a frío (CDH), dando el puntapié inicial hacia el entendimiento de las características genéticas y fisiológicas de la tolerancia a frío. Se establecieron sistemas de recirculación en acuicultura (RAS) para simular periodos de hibernación en laboratorio. Se observó un valor de LET de 8,6°C y de TCCA de 16,7°C no se observó correlación entre CDH y el peso. Los valores de CDH no presentaron una distribución normal, identificándose tres grupos de tolerancia: alta, media y baja. CDH no sería un carácter cuantitativo y por lo tanto no sería plausible de ser ingresado en programas de mejoramiento. Considerando los resultados obtenidos recomendamos suspender la alimentación a la temperatura cercana de 18°C y tomar medidas de manejo al llegar a los 10°C sin importar el tamaño de los ejemplares. Por otro lado, estudios con poblaciones mayores y de genética más diversa deberán realizarse para determinar si la tolerancia a bajas temperaturas es un parámetro factible de incorporarse a programas de mejoramiento genético.Ítem Acceso Abierto First DNA barcode reference library for the identification of South American freshwater fish from the lower Paraná River(Public Library of Science (PLOS), 2016-07-21) Díaz, Juan; Villanova, Gabriela Vanina; Brancolini, Florencia; Del Pazo, Felipe; Posner, Victoria María; Grimberg, Alexis; Arranz, Silvia EdaÍtem Acceso Abierto Haplotypes traceability and genetic variability of the breeding population of pacu (Piaractus mesopotamicus) revealed by mitochondrial DNA(Sociedade Brasileira de Genética, 2021) De Freitas, Milena V.; Ariede, Raquel B.; Hata, Milene Elissa; Mastrochirico-Filho, Vito Antonio; Del Pazo, Felipe; Villanova, Gabriela Vanina; Mendonça, Fernando F.; Porto-Foresti, Fábio; Hashimoto, Diogo Teruo; http://orcid.org/0000-0002-6434-2590; http://orcid.org/0000-0002-0641-164X; http://orcid.org/0000-0003-1246-5836; http://orcid.org/0000-0002-3550-2671; http://orcid.org/0000-0001-5039-6099; http://orcid.org/0000-0002-9503-3950; http://orcid.org/0000-0002-4806-9897; http://orcid.org/0000-0001-8845-3845; http://orcid.org/0000-0002-8808-2498The main objective of this study was to estimate the genetic diversity levels and haplotype traceability in pacu Piaractus mesopotamicus from the breeding program located in Brazil by analyses of the mitochondrial DNA control region (mtDNA). Moreover, broodstocks from eight commercial fish farms were used for comparative evaluation, four from Brazil (Br1-Br4) and four from Argentina (Ar1-Ar4). The descriptive results revealed 47 polymorphic sites and 51 mutations, which evidenced 34 haplotypes. Ten haplotypes were shared among fish farms and 24 were exclusive. The nucleotide diversity (π) ranged from 0.00031 to 0.01462 and haplotype diversity (Hd) from 0.125 to 0.868. The analysis of molecular variance (AMOVA) indicated high structure present in the analyzed stocks (FST = 0.13356 and ФST = 0.52707). The genetic diversity was high in most of the commercial broodstocks, especially those from Brazil. We observed seven haplotypes in the genetic breeding population, of which four were exclusive and three shared among the commercial fish farms. The genetic diversity was moderate (π = 0.00265 and Hd = 0.424) and considered appropriated for this breeding population of pacu. Our results provide support for the genetic diversity maintenance and mtDNA traceability of pacu commercial broodstocks.Ítem Acceso Abierto Omicron waves in Argentina: dynamics of SARS-CoV-2 lineages BA.1, BA.2 and the emerging BA.2.12.1 and BA.4/BA.5(MDPI, 2023-01-22) Torres, Carolina; Nabaes Jodar, Mercedes; Acuña, Dolores; Zambrana Montaño, Romina Micaela; Culasso, Andrés Carlos Alberto; Amadio, Ariel Fernando; Aulicino, Paula; Ceballos, Santiago; Cacciabue, Marco; Debat, Humberto; Dus Santos, María José; Eberhardt, María Florencia; Espul, Carlos; Fay, Fabián; Fernández, María Ailén; Fernández, Franco; Fernandez Muñoz, Juan Manuel; Ferrini, Florencia; Gallego, Fernando; Giri, Adriana Angélica; Cerri, Agustina; Bolatti, Elisa María; Gismondi, María Ines; Goya, Stephanie; Gramundi, Iván; Irazoqui, José Matías; König, Guido Alberto; Leiva, Viviana; Lucero, Horacio; Marquez, Nathalie; Nardi, Cristina; Ortiz, Belén; Pianciola, Luis; Pintos, Carolina Beatriz; Puebla, Andrea Fabiana; Rastellini, Carolina Victoria; Rojas, Alejandro Ezequiel; Sfalcin, Javier; Suárez, Ariel; Tittarelli, Estefanía; Toro, Rosana; Villanova, Gabriela Vanina; Ziehm, María Cecilia; Zimmermann, María Carla; Zunino, Sebastián; Proyecto PAIS Working Group; Valinotto, Laura; Viegas, MarianaÍtem Acceso Abierto Robust and scalable barcoding for massively parallel long‑read sequencing(Nature Research, 2022-12) Ezpeleta, Joaquín; Labari, Ignacio Garcia; Villanova, Gabriela Vanina; Bulacio, Pilar; Lavista Llanos, Sofía; Posner, Victoria María; Krsticevic, Flavia; Arranz, Silvia Eda; Tapia, ElizabethÍtem Acceso Abierto The lambda variant in Argentina: analyzing the evolution and spread of SARS-CoV-2 lineage C.37(MDPI, 2023-06-16) Nabaes Jodar, Mercedes; Torres, Carolina; Mojsiejczuk, Laura; Acuña, Dolores; Valinotto, Laura; Goya, Stephanie; Natale, Monica; Alexay, Sofia; Amadio, Ariel Fernando; Irazoqui, José Matías; Fernández, Franco; Acevedo, Maria Elina; Alvarez Lopez, Cristina; Angelletti, Andres; Aulicino, Paula; Bolatti, Elisa María; Brusés, Bettina; Cacciabue, Marco; Cavatorta, Ana Laura; Cerri, Agustina; Cordero, Andres; Debat, Humberto; Dus Santos, María José; Eberhardt, María Florencia; Ercole, Regina; Espul, Carlos; Farber, Marisa; Fay, Fabián; Fernández, María Ailén; Ferrini, Florencia; Formichelli, Laura; Ceballos, Santiago; Gallego, Fernando; Giri, Adriana Angélica; Gismondi, María Ines; Acevedo, Raul Maximiliano; Gramundi, Iván; Ibañez, María Eugenia; König, Guido Alberto; Leiva, Viviana; Lorenzini Campos, Melina; Lucero, Horacio; Marquez, Nathalie; Mazzeo, Melina; Mistchenko, Alicia Susana; Montoto, Luciana; Muñoz, Marianne; Nadalich, Victoria; Nardi, Cristina; Ortiz, Belén; Pianciola, Luis; Pintos, Carolina Beatriz; Puebla, Andrea Fabiana; Rastellini, Carolina Victoria; Rojas, Alejandro Ezequiel; Sfalcin, Javier; Suárez, Ariel; Theaux, Clara; Thomas, Guillermo; Tittarelli, Estefanía; Toro, Rosana; Villanova, Gabriela Vanina; Wenk, Gretel; Ziehm, María Cecilia; Zimmermann, María Carla; Zimmermann, María Carla; Proyecto PAIS Working Group; Viegas, Mariana