Secuenciación genómica y caracterización de una cepa nativa de Photorhabdus sp. P32.
| dc.contributor.advisor | Palma Dovis, Leopoldo | |
| dc.contributor.coadvisor | Daurelio, Lucas | |
| dc.creator | Zimmermann, Jorge A. | |
| dc.date.accessioned | 2025-03-28T12:02:50Z | |
| dc.date.available | 2025-03-28T12:02:50Z | |
| dc.date.issued | 2025 | |
| dc.description.abstract | Los nematodos del género Heterorhabditis son parásitos de insectos y han demostrado poseer potencial para ser utilizados como agentes de control biológico. Estos nematodos penetran a través de las aberturas naturales de los insectos o su cutícula y una vez en el interior, liberan bacterias simbióticas entomopatógenas en el hemocele. El género Heterorhabditis está asociado con enterobacterias del género Photorhabdus. Estas bacterias liberan toxinas insecticidas que producen la muerte de los insectos. Además, pueden sintetizar otros metabolitos secundarios con potencial biotecnológico y farmacéutico, destinadas a inhibir la proliferación de otros microorganismos competidores y oportunistas. El objetivo de este trabajo fue secuenciar el genoma de la cepa P32 de Photorhabdus sp., aislada de larvas de Galleria mellonella infestadas con Heterorhabditis amazonensis y realizar una caracterización de la misma mediante la utilización de diferentes herramientas bioinformáticas. La bacteria fue aislada a partir de muestras de suelo obtenidas en Calilegua, provincia de Jujuy, Argentina. El tamaño del borrador del genoma de Photorhabdus P32 fue de 5.36 Megabases con un contenido G+C de 42,5%. Se identificaron 4614 CDSs, de los cuales 141 corresponden a funciones desconocidas. El análisis de identidad promedio de nucleótidos (orthoANI) mostró un 96,94 % de similitud entre Photorhabdus P32 y Photorhabdus aballayi, confirmando que esta cepa pertenece a dicha especie. A través de este estudio, pudimos caracterizar el genoma de Photorhabdus P32, en el que identificamos proteínas con potencial actividad insecticida, quitinasas y regiones de clusters de genes de metabolitos secundarios con actividad citotóxica y de sideróforo. Finalmente, el análisis filogenético identificó a Photorhabdus P32 como una cepa perteneciente a la especie P. aballayi. | |
| dc.description.abstract | Nematodes of the Heterorhabditis genus are insect parasites and have demonstrated the potential to be used as biological control agents. These nematodes penetrate through the natural openings of insects or their cuticle and once inside, they release symbiotic entomopathogenic bacteria into the hemocoel. The genus Heterorhabditis is associated with enterobacteria of the Photorhabdus genus. These bacteria release insecticidal toxins that kill the insects. In addition, they can synthesize other secondary metabolites with biotechnological and pharmaceutical potential, intended to inhibit the proliferation of other competing and opportunistic microorganisms. The objective of this work was to sequence the genome of the strain P32 of Photorhabdus sp., isolated from Galleria mellonella larvae infested with Heterorhabditis amazonensis and to characterize it using different bioinformatics tools. The bacteria was isolated from soil samples obtained in Calilegua, province of Jujuy, Argentina. The size of the draft genome of Photorhabdus P32 was 5.36 Megabases with a G + C content of 42.5%. A total of 4614 CDSs were identified, 141 of which correspond to unknown functions. The average nucleotide identity (orthoANI) analysis showed a 96.94% similarity between Photorhabdus P32 and Photorhabdus aballayi, confirming that this strain belongs to that species. Through this study, we were able to characterize the genome of Photorhabdus P32, in which we identified proteins with potential insecticidal activity, chitinases and regions of secondary metabolite gene clusters with cytotoxic and siderophore activity. Finally, phylogenetic analysis identified Photorhabdus P32 as a strain belonging to the species P. aballayi. | |
| dc.description.fil | Fil.: Zimmermann, Jorge A..Facultad de Ciencias Agrarias. Universidad Nacional de Rosario | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/2133/29138 | |
| dc.language.iso | es | |
| dc.publisher | Facultad de Ciencias Agrarias. Universidad Nacional de Rosario | |
| dc.rights | openAccess | |
| dc.rights.holder | El autor | |
| dc.rights.text | Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International | en |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ | |
| dc.subject | Photorhabdus | |
| dc.subject | Enterobacteria | |
| dc.subject | Insecticida | |
| dc.subject | Genoma | |
| dc.subject | Heterohabditis | |
| dc.subject | Control biológico | |
| dc.title | Secuenciación genómica y caracterización de una cepa nativa de Photorhabdus sp. P32. | |
| dc.type | tesis | |
| dc.type.collection | tesis | |
| dc.type.other | tesis de doctorado | |
| dc.type.version | acceptedVersion | |
| lom.educational.context | superior_no_universitario | |
| lom.educational.context | grado | |
| lom.educational.context | posgrado | |
| lom.educational.difficulty | dificil | |
| lom.educational.interactivity | expositiva | |
| lom.educational.typicalAgeRange | adultos |