Secuenciación genómica y caracterización de una cepa nativa de Photorhabdus sp. P32.

Los nematodos del género Heterorhabditis son parásitos de insectos y han demostrado poseer potencial para ser utilizados como agentes de control biológico. Estos nematodos penetran a través de las aberturas naturales de los insectos o su cutícula y una vez en el interior, liberan bacterias simbióticas entomopatógenas en el hemocele. El género Heterorhabditis está asociado con enterobacterias del género Photorhabdus. Estas bacterias liberan toxinas insecticidas que producen la muerte de los insectos. Además, pueden sintetizar otros metabolitos secundarios con potencial biotecnológico y farmacéutico, destinadas a inhibir la proliferación de otros microorganismos competidores y oportunistas. El objetivo de este trabajo fue secuenciar el genoma de la cepa P32 de Photorhabdus sp., aislada de larvas de Galleria mellonella infestadas con Heterorhabditis amazonensis y realizar una caracterización de la misma mediante la utilización de diferentes herramientas bioinformáticas. La bacteria fue aislada a partir de muestras de suelo obtenidas en Calilegua, provincia de Jujuy, Argentina. El tamaño del borrador del genoma de Photorhabdus P32 fue de 5.36 Megabases con un contenido G+C de 42,5%. Se identificaron 4614 CDSs, de los cuales 141 corresponden a funciones desconocidas. El análisis de identidad promedio de nucleótidos (orthoANI) mostró un 96,94 % de similitud entre Photorhabdus P32 y Photorhabdus aballayi, confirmando que esta cepa pertenece a dicha especie. A través de este estudio, pudimos caracterizar el genoma de Photorhabdus P32, en el que identificamos proteínas con potencial actividad insecticida, quitinasas y regiones de clusters de genes de metabolitos secundarios con actividad citotóxica y de sideróforo. Finalmente, el análisis filogenético identificó a Photorhabdus P32 como una cepa perteneciente a la especie P. aballayi.