Diseño de una arquitectura en pipeline para la descarga y análisis de secuencias de promotores en Solanum lycopersicum

Se presenta el desarrollo de una arquitectura en pipeline que automatiza la descarga de promotores de Solanum lycopersicum desde la Sol Genomics Network y luego los analiza con el programa MEME y TOMTOM. El código está disponible en www.github.com/lalebot/pip-prom-tom y utiliza Git como software de versionado de software. Se combina el uso de threads en Python, expresiones regulares y base de datos SQLite que conjuntamente disminuyen el tiempo de descarga de los promotores y optimiza la utilización de recursos informáticos. La presente metodología es potencialmente aplicable a otras áreas biológicas.