El presente estudio busca establecer un marco teórico para la clasificación racional y efectiva de cepas del grupo Lactococcus lactis, así como desarrollar una herramienta bioinformática destinada a la minería génica y el perfilamiento funcional de cepas bacterianas. Adicionalmente, se pretende diseñar un sistema de clasificación integral para las genomoespecies del grupo Bacillus cereus, integrando datos moleculares, ecológicos y evolutivos. Por último, se utilizarán datos de secuenciación metagenómica para inferir rasgos funcionales (positivos y negativos) asociados al microbioma del rumen.