Diseño, desarrollo y validación funcional de un ensayo de secuenciación de paneles de genes para el diagnóstico genético

Abstract

En este trabajo se abordó el desarrollo y la validación funcional de una técnica para la obtención de variantes genéticas humanas a partir de una muestra de sangre. Se planteó un protocolo que consiste en los pasos que inician en la extracción de ADN a partir de una muestra con EDTA. Se adaptó un protocolo comercial para la captura por hibridación de secuencias blanco. Una vez obtenido el archivo fastq se le realizaron los análisis de calidad correspondientes, los mismos resultaron satisfactorios. El mapeo de las secuencias se llevaron a cabo con el software bwa. A partir de este alineamiento, se procedió a realizar las prácticas recomendadas por el Broad Institute para la obtención de variantes. El análisis final consistió en la búsqueda en bases de datos de las más de 400 variantes encontradas para la identificación de su significancia clínica. Se deja asentado que para la validación clínica final del método se deberá contar con controles extra y mayor cantidad de muestras.