Examinando por Autor "Anselmino, Luciano"

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    Análisis computacional de la expresión de proteínas Vav en melanoma cutáneo
    (Facultad de Ciencias Agrarias, 2023) Avila, Aylén; Menacho Márquez, Mauricio; Anselmino, Luciano
    Las proteínas VAV son factores de intercambio de nucleótidos guanina (GEFs) que desempeñan roles esenciales en diversos procesos fisiológicos y patológicos. Esta familia está compuesta por tres miembros que normalmente muestran redundancia funcional y están asociados con funciones proactivas en el cáncer. Sin embargo, el papel de estas proteínas en el melanoma ha sido poco explorado. Nuestro objetivo fue caracterizar, mediante enfoques bioinformáticos, los procesos regulados específicamente por cada miembro de esta familia de proteínas en el melanoma. En primer lugar, se descargaron datos de expresión génica de personas con melanoma cutáneo de la base de datos “ Atlas del Genoma del Cáncer” (TCGA) utilizando el paquete del entorno de programación R, TCGABiolinks. Las personas fueron divididas según la expresión alta o baja de Vav1, Vav2 y Vav3, y se construyeron gráficos de supervivencia utilizando el estimador de Kaplan-Meier. Se encontró asociación entre una alta expresión de Vav2 con un peor pronóstico (p=0.045), mientras que la alta expresión de Vav1 y Vav3 se correlacionó con una mayor probabilidad de supervivencia de las personas (p=0.0022 y 0.0019 respectivamente). Luego, se identificaron genes diferencialmente expresados (DEGs) entre los grupos utilizando el paquete edgeR que aplica el método de máxima verosimilitud condicional ajustada por cuantiles. Los DEGs fueron seleccionados para valores de |FC|>1 y de FDR<0.01. Se realizó un análisis de enriquecimiento funcional para cada grupo de DEGs utilizando el paquete ReactomePA y el software GSEA. Para estimar la infiltración de células inmunes y estromales en los tejidos tumorales, se calculó el Puntaje Inmune y el Puntaje de Pureza Tumoral basados en perfiles de expresión génica de células inmunológicas del microambiente tumoral, utilizando los algoritmos estimate y xCell. Luego, las firmas de infiltración de células inmunes se evaluaron mediante ocho algoritmos diferentes utilizando la aplicación estimate y TIMER2.0. Se encontró una fuerte correlación positiva entre la expresión de Vav1 y las firmas de células inmunes (p=2.2E-16). No se observó correlación para la expresión de Vav2 o Vav3. Sin embargo, las Puntuaciones Inmune y de Microambiente estuvieron fuerte y positivamente asociadas con las expresiones de Vav1 (valor de p<3E-16) y Vav3 (valor de p<3E-9). En conjunto, nuestros resultados sugieren que altas expresiones de Vav1 y Vav3, combinadas con una baja expresión de Vav2, resultan en un mejor pronóstico en el contexto del melanoma. Este pronóstico puede estar relacionado por la influencia de Vav1 sobre la comunicación entre las células tumorales y su microambiente, mientras que la alta expresión de Vav3 podría regular la activación de vías de señalización de la célula tumoral, promoviendo una mayor inmunogenicidad. Palabras Clave: Bioinformática, Melanoma, Vav.
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    Estudio de expresión de RAC1 y su efecto sobre el desarrollo de resistencia a quimioterapéuticos de uso convencional en el tratamiento de cáncer colorrectal
    (2023) Otterstedt Boglione, Katia Belén; Menacho Márquez, Mauricio; Anselmino, Luciano; Malizia, Florencia
    El cáncer colorrectal (CCR) tiene una alta incidencia y mortalidad a nivel mundial. Su tratamiento involucra el uso de drogas citotóxicas como el 5-fluorouracilo (5-FU), uno de los quimioterapéuticos más utilizados contra este tipo tumoral. Sin embargo, es común que los pacientes desarrollen resistencia a este tratamiento. Cada vez más evidencia apunta a que la ruta de las Rho GTPasas podría ser un importante objetivo para paliar la resistencia a quimioterapéuticos en diferentes tipos de cáncer. Entre las Rho GTPasas más estudiadas y mejor conservadas en las especies eucariotas se encuentra Rac1. Se ha descrito que cumple un papel central en la reorganización del citoesqueleto de actina y que actúa regulador transcripcional de varios genes involucrados en la proliferación y el ciclo celular. En la mayoría de los cánceres, una expresión elevada de RAC1 se correlaciona con una menor probabilidad de sobrevida para el paciente. Por otro lado, el reposicionamiento de drogas se refiere al uso de fármacos en el tratamiento de patologías para las cuales no fueron originalmente formulados. Este enfoque es preferido sobre el diseño de fármacos de novo debido a que permite el ahorro tanto de tiempo como de recursos económicos. En este proyecto proponemos utilizar técnicas bioinformáticas para generar un perfil de expresión génica asociado a una alta expresión de RAC1 en pacientes de cáncer colorrectal con el fin de identificar vías celulares enriquecidas en el fenotipo. También se evalúa la posibilidad de utilizar un fármaco en reposicionamiento como agente resensibilizante para poder sobrepasar el obstáculo que la resistencia a 5-FU presenta para la terapia contra el CCR.
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    Reposicionamiento de drogas de efecto sobre vías metabólicas en el tratamiento de cáncer colorrectal
    (Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas., 2020) Anselmino, Luciano; Menacho-Márquez, Mauricio
    El cáncer colorrectal (CCR) tiene una alta incidencia y mortalidad a nivel mundial, su tratamiento involucra el uso de drogas citotóxicas como el 5-fluorouracilo (5-FU). El reposicionamiento de drogas en oncología se refiere al uso de fármacos originalmente formulados para otras indicaciones que mostraron potencial antitumoral. En este trabajo, evaluamos el potencial anticancerígeno sobre líneas celulares de CCR de un grupo de fármacos con efectos sobre el metabolismo celular, todos ellos inhibieron significativamente la proliferación de las células. De las combinaciones probadas, M+P resultó atractiva ya que demostró efectos incluso a bajas dosis, modificando tanto la capacidad migratoria celular, como los niveles de apoptosis. Además, mantuvo su acción sobre líneas de CCR resistentes a 5-FU y varios modelos in vivo. Por otro lado, a través de enfoques computacionales identificamos otros posibles candidatos a reposicionar en CCR resistente a 5-FU. Nuestros resultados demuestran que el reposicionamiento de drogas es una herramienta con un alto potencial para el desarrollo de nuevas terapias anticancerígenas, ahorrando tiempo y recursos económicos en comparación con la generación de fármacos de novo.
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    Repositioning metformin and propranolol for colorectal and triple negative breast cancers treatment
    (Nature Research, 2021-04-14) Anselmino, Luciano ; Baglioni, M. V.; Malizia, Florencia; Cesatti Laluce, N.; Borini Etichetti, Carla María; Martínez Marignac, V. L.; Rozados, Viviana; Scharovsky, O. G.; Girardini, Javier; Rico, María José ; Menacho Márquez, Mauricio