Draft genome sequence data of Cercospora kikuchii, a causal agent of Cercospora leaf blight and purple seed stain of soybeans

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dc.citation.titleData in brief
dc.citation.volume27
dc.creatorSautua, Francisco José
dc.creatorGonzalez, Sergio A.
dc.creatorDoyle, Vinson P.
dc.creatorBerretta, Marcelo F.
dc.creatorGordó, Manuela
dc.creatorScandiani, María Mercedes
dc.creatorRivarola, Máximo L.
dc.creatorFernández, Paula
dc.creatorCarmona, Marcelo Aníbal
dc.date.accessioned2021-03-08T15:18:39Z
dc.date.available2021-03-08T15:18:39Z
dc.date.issued2019-10-21
dc.descriptionCercospora kikuchii (Tak. Matsumoto & Tomoy.) M.W. Gardner 1927 is an ascomycete fungal pathogen that causes Cercospora leaf blight and purple seed stain on soybean. Here, we report the first draft genome sequence and assembly of this pathogen. The C. kikuchii strain ARG_18_001 was isolated from soybean purple seed collected from San Pedro, Buenos Aires, Argentina, during the 2018 harvest. The genome was sequenced using a 2 × 150 bp paired-end method by Illumina NovaSeq 6000. The C. kikuchii protein-coding genes were predicted using FunGAP (Fungal Genome Annotation Pipeline). The draft genome assembly was 33.1 Mb in size with a GC-content of 53%. The gene prediction resulted in 14,856 gene models/14,721 protein coding genes. Genomic data of C. kikuchii presented here will be a useful resource for future studies of this pathosystem. The data can be accessed at GenBank under the accession number VTAY00000000 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/VTAY00000000.es
dc.description.filFil: Sautua, Francisco José. Universidad de Buenos Aires (UBA). Facultad de Agronomía. Catedra de Fitopatología; Argentina.
dc.description.filFil: González, Sergio A. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas (CICVYA). Instituto De Investigación Biotecnología; Argentina.
dc.description.filFil: González, Sergio A. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO); Argentina
dc.description.filFil: Doyle, Vinson P. Louisiana State University Agricultural Center (LSU AgCenter). Department of Plant Pathology and Crop Physiology; United States.
dc.description.filFil: Berretta, Marcelo F. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); Argentina.
dc.description.filFil: Berretta, Marcelo F. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas (CICVYA). Instituto de Microbiología y Zoología Agrícola (IMyZA); Argentina.
dc.description.filFil: Gordó, Manuela. Laboratorio Agrícola Río Paraná; Argentina.
dc.description.filFil: Scandiani, María Mercedes. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Centro de Referencia de Micología (CEREMIC); Argentina.
dc.description.filFil: Rivarola, Máximo L. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas (CICVYA). Instituto De Investigación Biotecnología; Argentina.
dc.description.filFil: Rivarola, Máximo L. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO); Argentina.
dc.description.filFil: Rivarola, Máximo L. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); Argentina.
dc.description.filFil: Fernández, Paula. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas (CICVYA). Instituto De Investigación Biotecnología; Argentina.
dc.description.filFil: Fernández, Paula. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO); Argentina.
dc.description.filFil: Fernández, Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); Argentina.
dc.description.filFil: Fernández, Paula. Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas; Argentina.
dc.description.filFil: Carmona, Marcelo Aníbal. Universidad de Buenos Aires (UBA). Facultad de Agronomía. Catedra de Fitopatología; Argentina.
dc.description.sponsorshipUniversidad de Buenos Aires (UBA): Project UBACyT 20020170100147BAes
dc.description.sponsorshipBASF Argentinaes
dc.formatapplication/pdf
dc.format.extent1-7
dc.identifier.issn2352-3409
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/2133/20033
dc.language.isoenges
dc.publisherElsevieres
dc.relation.publisherversionhttps://doi.org/10.1016/j.dib.2019.104693es
dc.relation.publisherversionhttps://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352340919310480?via%3Dihubes
dc.rightsopenAccesses
dc.rights.holderUniversidad Nacional de Rosarioes
dc.rights.holderSautua, Francisco Josées
dc.rights.holderGonzález, Sergio A.es
dc.rights.holderDoyle, Vinson P.es
dc.rights.holderBerretta, Marcelo F.es
dc.rights.holderGordó, Manuelaes
dc.rights.holderScandiani, María Mercedeses
dc.rights.holderRivarola, Máximo L.es
dc.rights.holderFernández, Paulaes
dc.rights.holderCarmona, Marcelo A.es
dc.rights.textAttribution 4.0 International (CC BY 4.0)es
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/*
dc.subjectCercospora kikuchiies
dc.subjectDraft Genomees
dc.subjectNext Generation Sequencing (NGS)es
dc.subjectCercospora Leaf Blightes
dc.subjectPurple Seed Staines
dc.subjectAgriculturees
dc.titleDraft genome sequence data of Cercospora kikuchii, a causal agent of Cercospora leaf blight and purple seed stain of soybeanses
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