Análisis de la distribución de potenciales cuádruplex de Guanina (PQS) en el genoma de tripanosomátidos y su posible relación con el control de la expresión génica.

Fecha

2017

Título de la revista

ISSN de la revista

Título del volumen

Editor

Resumen
Los tripanosomátidos son una familia de eucariotas unicelulares con especies causantes de importantes enfermedades en el ser humano. Los genes de estos organismos suelen organizarse en lo que se conoce como unidades de transcripción policistrónica (PTUs), consistente en un grupo de genes (y secuencias intergénicas) adyacentes en la misma hebra, que se transcriben en forma conjunta dando lugar a una única molécula de ARN (ARN policistrónico). Los ARNm maduros son producidos a partir de los ARN policistrónicos mediante un proceso de maduración que incluye el fenómeno de trans-splicing y poliadenilación. Actualmente se conocen pocos detalles sobre los mecanismos de regulación de la expresión génica tanto a nivel transcripcional (inicio y terminación de la síntesis de los ARN policistrónicos) como post-transcripcional (maduración, estabilidad y traducción de los ARNm). Los cuádruples de guanina son estructuras secundarias del ADN o ARN formadas en regiones ricas en guaninas. Se ha descrito la importancia de estas estructuras en la regulación de la expresión génica en diversos organismos. En el presente trabajo se realizó un análisis bioinformático de la frecuencia y distribución de cuádruples putativos de guanina (PQSs) en los genomas de distintas especies de Leishmania y Trypanosoma, a fin de evaluar su posible impacto en la regulación de la expresión génica a nivel transcripcional y post-transcripcional. En Trypanosoma se observó una densidad baja de PQSs a nivel genómico con un patrón poco claro entre las distintas especies. Por otro lado, en Leishmania se observó una mayor densidad de PQSs a nivel genómico, con una distribución bien definida y similar entre las tres especies analizadas. En este último género, la densidad de PQSs aumenta en la hebra molde de la región adyacente al extremo terminal de las PTUs, por lo cual es posible que los cuádruples de guanina puedan estar vinculados a la terminación de la transcripción. Al analizar la distribución de PQSs dentro de las PTUs de ambos géneros, se observó una diferencia muy marcada en la densidad de PQSs entre las secuencias génicas e intergénicas (con una muy baja densidad de PQSs en las primeras en relación a las segundas). Esto podría ser indicio de algún rol de los cuádruples de guanina en las etapas maduración, estabilidad y/o traducción del ARNm.

Palabras clave

Guanina, Expresión génica, Trypanosoma, Bioinformática

Citación