May the force (field) be with you: on the importance of conformational searches in the prediction of NMR chemical shifts

dc.citation.titleMarine Drugs
dc.citation.volume20
dc.contributor.orcidhttps://orcid.org/0000-0001-9282-1575
dc.creatorCuadrado, Cristina
dc.creatorHernández Daranas, Antonio
dc.creatorSarotti, Ariel Marcelo
dc.date.accessioned2024-08-15T12:58:39Z
dc.date.available2024-08-15T12:58:39Z
dc.date.issued2022-11-08
dc.description.abstractNMR data prediction is increasingly important in structure elucidation. The impact of force field selection was assessed, along with geometry and energy cutoffs. Based on the conclusions, we propose a new approach named mix-J-DP4, which provides a remarkable increase in the confidence level of complex stereochemical assignments—100% in our molecular test set—with a very modest increment in computational cost.
dc.description.filFil: Cuadrado, Cristina. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Instituto de Productos Naturales y Agrobiología; España.
dc.description.filFil: Hernández Daranas, Antonio. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Instituto de Productos Naturales y Agrobiología; España.
dc.description.filFil: Sarotti, Ariel Marcelo. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Química Rosario (IQUIR-CONICET); Argentina.
dc.description.sponsorshipUniversidad Nacional de Rosario (UNR): BIO 500 and 567
dc.description.sponsorshipAgencia Nacional de Promoción de la Investigación, el Desarrollo Tecnológico y la Innovación (Agencia I+D+i): PICT 2016-0116, PICT 2017-1524, and PICT 2019-4052
dc.description.sponsorshipConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET): PIP 11220200102205CO
dc.description.sponsorshipMinisterio de Ciencia e Innovación (MICINN): PID2019-109476RB-C21
dc.description.sponsorshipAgencia Canaria de Investigación, Innovación y Sociedad de la Información (ACIISI-FEDER): ProID2021010118
dc.description.versionpeerreviewed
dc.format.extent1-12
dc.identifier.issn1660-3397
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/2133/27581
dc.language.isoen
dc.publisherMDPI
dc.relation.publisherversionhttps://doi.org/10.3390/md20110699
dc.relation.publisherversionhttps://www.mdpi.com/1660-3397/20/11/699
dc.rightsopenAccess
dc.rights.holderCuadrado, Cristina
dc.rights.holderHernández Daranas, Antonio
dc.rights.holderSarotti, Ariel Marcelo
dc.rights.holderUniversidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas
dc.rights.textAttribution 4.0 Internationalen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subjectStructural elucidation
dc.subjectStereochemistry
dc.subjectNuclear magnetic resonance
dc.subjectQuantum mechanical calculations
dc.subjectMolecular mechanics force field
dc.titleMay the force (field) be with you: on the importance of conformational searches in the prediction of NMR chemical shifts
dc.typearticulo
dc.type.collectionarticulo
dc.type.versionpublishedVersion

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