MultimerMapper: Una Herramienta para el Análisis y Visualización de Datos Generados con AlphaFold2-multimer

Abstract

El presente trabajo se centra en la lógica detrás del desarrollo de MultimerMapper, una herramienta innovadora diseñada para el análisis y visualización de datos obtenidos con AlphaFold2-multimer. MultimerMapper facilita la exploración detallada de interacciones proteína-proteína en complejos, utilizando un enfoque que captura la variabilidad estructural de estas biomoléculas. Mediante el uso de técnicas avanzadas de bioinformática y visualización, se ha logrado integrar la información proveniente de múltiples modelos estructurales para crear representaciones visuales interactivas en 2D y 3D, situando las superficies de interacción y los contactos residuo-residuo como eje central. MultimerMapper se presenta como una herramienta prometedora en el campo de la bioinformática estructural, ofreciendo nuevas perspectivas para futuras investigaciones sobre la dinámica de interacciones dentro de complejos proteicos de orden superior.This work focuses on the logic behind the development of MultimerMapper, an innovative tool designed for the analysis and visualization of data obtained with AlphaFold2-multimer. MultimerMapper facilitates detailed exploration of protein-protein interactions in complexes, using an approach that captures the structural variability of these biomolecules. Using advanced bioinformatics and visualization techniques, information from multiple structural models has been integrated to create interactive visual representations in 2D and 3D, with special focus in interaction surfaces and residue-residue contacts. MultimerMapper is presented as a promising tool in the field of structural bioinformatics, offering new perspectives for future research on the dynamics of interactions within higher-order protein complexes.