Examinando por Autor "Repizo, Guillermo Daniel"
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Ítem Acceso Abierto Acinetobacter baumannii NCIMB8209: a rare environmental strain displaying extensive insertion sequence-mediated genome remodeling resulting in the loss of exposed cell structures and defensive mechanisms(American Society for Microbiology, 2020-07-29) Repizo, Guillermo Daniel; Espariz, Martín; Seravalle, Joana L.; Díaz Miloslavich, Juan Ignacio; Steimbrüch, Bruno A.; Shuman, Howard A.; Viale, Alejandro M.Ítem Acceso Abierto Acquisition of plasmids conferring carbapenem and aminoglycoside resistance and loss of surface-exposed macromolecule structures as strategies for the adaptation of Acinetobacter baumannii CC104O/CC15P strains to the clinical setting(Microbiology Society, 2020-03-26) Cameranesi, María Marcela; Paganini, Julián; Limansky, Adriana S.; Morán Barrio, Jorgelina ; Salcedo, Suzana P.; Viale, Alejandro M.; Repizo, Guillermo DanielÍtem Acceso Abierto Bioinformatic analysis of the Type VI Secretion System and its potential toxins in the Acinetobacter genus(Frontiers Media, 2019-11-01) Repizo, Guillermo Daniel; Espariz, Martín; Seravalle, Joana L.; Salcedo, Suzana P.Ítem Acceso Abierto Catalases of the polyextremophylic andean isolate Acinetobacter sp. Ver 3 confer adaptive response to H2O2 and UV radiation(Wiley, 2020-02-09) Sartorio, Mariana Gabriela; Repizo, Guillermo Daniel; Cortez, Néstor; https://orcid.org/0000-0003-1318-8738; Perdomo, Virginia: assistance with qRT-PCR measurements; Dr. Carrillo, Néstor: review of the manuscriptThe polyextremophilic strain Acinetobacter sp. Ver3 isolated from high-altitude Andean lakes exhibits elevated tolerance to UV-B radiation and to pro-oxidants, a feature that has been correlated to its unusually high catalase activity. The Ver3 genome sequence analysis revealed the presence of two genes coding for monofunctional catalases: AV3KatE1 and AV3KatE2, the latter harboring an N-terminal signal peptide. We show herein that AV3KatE1 displays one of the highest catalytic activities reported so far and is constitutively expressed at relatively high amounts in the cytosol, acting as the main protecting catalase against H2O2 and UV-B radiation. The second catalase, AV3KatE2, is a periplasmic enzyme strongly induced by both peroxide and UV, conferring supplementary protection against pro-oxidants. The N-terminal signal present in AV3KatE2 was required not only for transport to the periplasm via the twin-arginine translocation pathway, but also for proper folding and subsequent catalytic activity. The analysis of catalase distribution among 114 Acinetobacter complete genomes revealed a great variability in the catalase classes, with A. baumannii clinical isolates exhibiting higher numbers of isoenzymes and the most variable profiles.Ítem Acceso Abierto Characterization of the diverse plasmid pool harbored by the blaNDM-1-containing Acinetobacter bereziniae HPC229 clinical strain(Public Library of Science (PLOS), 2019-11-19) Brovedan, Marco Alcides; Repizo, Guillermo Daniel; Marchiaro, Patricia M.; Viale, Alejandro M.; Limansky, Adriana S.Ítem Acceso Abierto Contribución del Sistema de Secreción Tipo 6 a la interacción del patógeno nosocomial Acinetobacter baumannii con el hospedador usando a Caenorhabditis elegans como modelo de infección(Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, 2019-03-22) Díaz Miloslavich, Juan Ignacio; Repizo, Guillermo DanielAcinetobacter baumannii es un patógeno bacteriano oportunista que es responsable de muchas de las infecciones intrahospitalarias causadas por bacterias Gram-negativas. Está clasificado por la Sociedad Americana de Enfermedades Infecciosas como uno de los seis microorganismos más importantes resistentes a múltiples antimicrobianos (MDR) en hospitales de todo el mundo. La reducción del impacto socioeconómico de las infecciones debidas a A. baumannii requiere de un conocimiento detallado de la fisiopatología del organismo. Entre los mecanismos de virulencia propuestos, el sistema de secreción tipo 6 (SST6) es una máquina que atraviesa las células y que trasloca proteínas efectoras tóxicas a células eucariotas y procariotas. Es por ello que se postula que podría contribuir a la patogénesis causada por dicha bacteria. Con el objeto de comprobar esta hipótesis, en este trabajo de tesina hicimos uso de un modelo de infección validado recientemente y hasta ahora nunca explorado en nuestro laboratorio: el nematodo Caenorhabditis elegans. Mediante el análisis de cepas bacterianas con características variadas en relación al SST6 y a través de diferentes bioensayos, logramos ahondar en el conocimiento en la interacción hospedador-patógeno. Pudimos así determinar que mientras algunas cepas no son capaces de provocar infección, otras causan la muerte en el término de 24 h. Entre las primeras, se encuentra la cepa A. baumannii NCIMB8209. Mediante la secuenciación de su genoma y el análisis posterior detectamos que ésta no codifica el SST6. Por otra parte, entre las cepas letales para el gusano se encuentran principalmente aquellas que codifican y expresan este sistema, que en el caso de la cepa A. baumannii ATCC 17978 resulta crítico para causar la muerte del nematodo. De esta forma, determinamos que el SST6 juega un papel importante en la virulencia de A. baumannii de una manera cepa dependiente. Proponemos que las diferencias observadas en esta interacción podrían deberse al conjunto de toxinas codificadas en cada genoma.Ítem Acceso Abierto CRISPR-based platform for carbapenemases and emerging viruses detection using Cas12a (Cpf1) effector nuclease(Taylor & Francis, 2020-06-02) Curti, Lucía Ana; Pereyra Bonnet, Federico; Repizo, Guillermo Daniel; Fay, Jessica Vannina; Salvatierra, Karina; Blariza, María José; Ibáñez Alegre, Macarena; Rinflerch, Adriana Raquel; Miretti, Marcos; Giménez, Carla AlejandraCRISPR-Cas12a (also called Cpf1) has been commonly used for genomic editing, based on its ability to generate precise double-stranded DNA (dsDNA) breaks. Recently, it was demonstrated that Cas12a exhibits unspecific ssDNAse activity upon target recognition. This feature allows CRISPR-Cas to be coupled with a ssDNA reporter and generate a fast, accurate and ultrasensitive molecular detection method. Here, we demonstrate that Cas12a was able to detect DNA target sequences corresponding to carbapenemases resistance genes such as KPC, NDM and OXA. Also, with the addition of a reverse-transcription step, we were able to detect viral RNA sequences from DENV, ZIKV and HANTV genomes. In all cases, assay run time was less than two hours. Additionally, we report attomolar levels of detection. This methodology was validated using clinical samples from patients infected with Dengue virus. Reactions were visualized by detection of a fluorescent signal, as well as by the use of a simple lateral flow strip. These results indicate that Cas12a is able to detect both DNA and RNA targets, making it an appropriate and convenient tool to detect all types of pathogens.Ítem Acceso Abierto Differential role of the T6SS in Acinetobacter baumannii virulence(Public Library of Science (PLOS), 2015-09-24) Repizo, Guillermo Daniel; Gagné, Stéphanie; Foucault-Grunenwald, Marie-Laure; Borges, Vitor; Charpentier, Xavier; Limansky, Adriana S.; Gomes, João Paulo; Viale, Alejandro M.; Salcedo, Suzana P.Ítem Acceso Abierto Genomic comparative analysis of the environmental Enterococcus mundtii against enterococcal representative species(BMC, 2014-06-18) Repizo, Guillermo Daniel; Espariz, Martín; Blancato, Víctor Sebastián; Suárez, Cristian Alejandro; Esteban, Luis; Magni, ChristianBackground Enterococcus mundtii is a yellow-pigmented microorganism rarely found in human infections. The draft genome sequence of E. mundtii was recently announced. Its genome encodes at least 2,589 genes and 57 RNAs, and 4 putative genomic islands have been detected. The objective of this study was to compare the genetic content of E. mundtii with respect to other enterococcal species and, more specifically, to identify genes coding for putative virulence traits present in enterococcal opportunistic pathogens. Results An in-depth mining of the annotated genome was performed in order to uncover the unique properties of this microorganism, which allowed us to detect a gene encoding the antimicrobial peptide mundticin among other relevant features. Moreover, in this study a comparative genomic analysis against commensal and pathogenic enterococcal species, for which genomic sequences have been released, was conducted for the first time. Furthermore, our study reveals significant similarities in gene content between this environmental isolate and the selected enterococci strains (sharing an “enterococcal gene core” of 805 CDS), which contributes to understand the persistence of this genus in different niches and also improves our knowledge about the genetics of this diverse group of microorganisms that includes environmental, commensal and opportunistic pathogens. Conclusion Although E. mundtii CRL1656 is phylogenetically closer to E. faecium, frequently responsible of nosocomial infections, this strain does not encode the most relevant relevant virulence factors found in the enterococcal clinical isolates and bioinformatic predictions indicate that it possesses the lowest number of putative pathogenic genes among the most representative enterococcal species. Accordingly, infection assays using the Galleria mellonella model confirmed its low virulence.Ítem Embargo Identificación y caracterización de las superóxido dismutasas en aislamientos bacterianos del género Acinetobacter(2022) Steimbrüch, Bruno A.; Repizo, Guillermo Daniel; Bartolotti, AnaAcinetobacter sp. Ver3 es una gammaproteobacteria gram (-) aislada en las Lagunas de Altura de la Puna Andina, ubicadas a 4000 msnm en el noroeste argentino. Esta cepa se caracteriza por presentar una alta tolerancia a la radiación UV-B y prooxidantes como H2O2 y Metilviólogeno. El genoma de la cepa Ver3 comprende los genes sodB y sodC que codifican superóxido dismutasas del tipo Fe (AV3SodB) y Cu/Zn (AV3SodC), respectivamente. Sin embargo, poco se conoce sobre el rol de estos genes en una cepa extremófila como Acinetobacter sp. Ver3. En este trabajo, develamos que la expresión de sodB permaneció inalterada en diferentes condiciones de estrés oxidativo, mientras que sodC fue regulada positivamente en presencia de luz azul, un conocido inductor de respuestas de estrés en Acinetobacter baumannii. Por otro lado, estudiamos los cambios en la actividad in vitro de ambas enzimas en respuesta a diversos agentes físicos y químicos. Además, se logró resolver la estructura cristalina de AV3SodB en una resolución de 1,34 Å, una de las más altas logradas para una enzima de este tipo. Curiosamente, los estudios de fraccionamiento celular revelaron que AV3SodB se encuentra exclusivamente en el citosol, mientras que AV3SodC también se encuentra en el periplasma bacteriano. De acuerdo con esta observación, un análisis bioinformático de los genomas de 53 especies de Acinetobacter señaló la presencia de al menos un tipo de SOD en cada compartimento, lo que sugiere que estas enzimas se requieren por separado para hacer frente al estrés oxidativo. Sorprendentemente, AV3SodC se encontró en un estado activo también en las vesículas de la membrana externa, probablemente ejerciendo un papel protector fuera de la célula y proporcionando así una línea de defensa adicional. En general, nuestro enfoque multidisciplinario destaca la relevancia de las enzimas SOD del género Acinetobacter, ya sea de origen ambiental o nosocomial, en la defensa antioxidante.Ítem Acceso Abierto Prevalence of Acinetobacter baumannii strains expressing the type 6 secretion system in patients with bacteremia(Taylor & Francis, 2017-07-31) Repizo, Guillermo DanielAcinetobacter baumannii (Ab) is an important nosocomial pathogen, of major concern worldwide due to its multi-drug resistance and the recent appearance of hyper-virulent strains in the clinical setting. Ab multi-drug resistant (MDR) strains are frequently associated to different types of infections, such as pneumonia, skin burns, endocarditis, meningitis and septicemia, prevalent in intensive care units. For these reasons, Ab has just been included by the World Health Organization in the list of critical priority pathogens for further studies and development of novel therapeutic approaches. In this respect, advanced knowledge of Ab physiology and mechanisms involved in environmental persistence, host colonization and virulence, all of which could be included in what is known as the physiopathology of the microorganism, is required to reduce the socio-economic impact caused by Ab infections. [...]Ítem Acceso Abierto Site-specific recombination at XerC/D sites mediates the formation and resolution of plasmid co-integrates carrying a blaOXA-58- and TnaphA6-resistance module in Acinetobacter baumannii(Frontiers Media, 2018-01-26) Cameranesi, María Marcela ; Morán Barrio, Jorgelina; Limansky, Adriana S.; Repizo, Guillermo Daniel; Viale, Alejandro M.Ítem Acceso Abierto The distinctive roles played by the superoxide dismutases of the extremophile Acinetobacter sp. Ver3(Nature Research, 2022-03-12) Steimbrüch, Bruno A.; Sartorio, Mariana Gabriela; Cortez, Néstor; Albanesi, Daniela; Lisa, María Natalia; Repizo, Guillermo DanielÍtem Acceso Abierto The environmental Acinetobacter baumannii isolate DSM30011 reveals clues into the preantibiotic era genome diversity, virulence potential, and niche range of a predominant nosocomial pathogen(Oxford University Press, 2017-08-26) Repizo, Guillermo Daniel; Viale, Alejandro M.; Borges, Vítor; Cameranesi, María Marcela; Taib, Najwa; Espariz, Martín; Brochier-Armanet, Céline; Gomes, João Paulo; Salcedo, Suzana P.